Tre nya delar inom databasen The Human Protein Atlas
2019-09-09
I dagarna har HPA-projektet släppt en ny version av The Human Protein Atlas. Den innebär den största uppdateringen hittills, med de helt nya delarna Blood Atlas och Brain Atlas samt en Metabolic Atlas som tagits fram i samarbete med Chalmers.
Projektet The Human Protein Atlas har som mål att kartlägga alla proteiner in människans celler, vävnader och organ. Alla data görs allmänt tillgängligt för forskare och företag, något som har bidragit till tusentals forskningsartiklar om människans biologi och sjukdomar. Den nya versionen är nummer 19 i ordningen.
The Human Protein Atlas består av sex separata delar varav atlasarna för blod, hjärna och metabolism nu alltså precis har släppts. Vi tror att alla de nya data som nu blir publika kommer att vara till stor nytta för fortsatt forskning inom dessa områden, säger Fredrik Pontén, som är kliniskt ansvarig för HPA-projektet vid IGP.
Materialet i Blood Atlas kan bli särskilt intressant för forskare som studerar immunceller och för utveckling av nya behandlingar av cancer och autoimmuna sjukdomar. Där presenteras gener som uppvisar högre aktivitet i olika typer av vita blodkroppar, inklusive gener vars aktivitet man tidigare inte sett i humana blodceller.
I Brain Atlas presenteras en kartläggning av proteiner i olika delar av hjärnan, inte bara hos människa utan även i mus och gris. Skillnader som finns mellan hjärncellerna hos de olika arterna kan få betydelse för hur resultat från djurmodeller överförs till forskning på människans hjärna.
Den nya Metabolic Atlas är den hittills mest omfattande kartläggningen av människans metabolism, med biokemisk information och samband för mer än 13 000 reaktioner, 4 000 unika substanser och 3 500 gener.
The Human Protein Atlas har tillsammans med tidskriften Science tagit fram en poster om projektets Blood Atlas. Den har publicerats in tidskriftens senaste nummer och om en månad kommer Brain Atlas-postern.
Mer information:
Pressmeddelande The Human Protein Atlas
The Human Protein Atlas webb
HPA-projektet vid IGP
-
Läkemedel mot epilepsi hämmar tumörutveckling i hjärnan
2019-11-28
Medicin som används mot en viss typ av epilepsi kan vara ett nytt sätt att behandla elakartade hjärntumörer hos spädbarn. En specifik mTOR-hämmare kan ta sig över blod-hjärnbarriären och både nå och attackera tumören där den finns. Det kan forskare från IGP visa, i samarbete med amerikanska och brittiska kollegor, och forskningsresultaten publiceras i den vetenskapliga tidskriften Cell Stem Cell.
-
Ny kombination av läkemedel effektiv mot aggressiva hjärntumörer
2019-11-25
Forskare vid IGP har identifierat en viss grupp av patienter med elakartade hjärntumörer av formen glioblastom som svarar på en behandling som inriktar sig mot cancergenen MYCN. Forskningsresultaten publiceras i den vetenskapliga tidskriften Cell Death & Disease.
-
Samband upptäckt mellan förlust av Y-kromosomen i blodceller och genetisk instabilitet
2019-11-20
I ett internationellt samarbetsprojekt har forskare vid IGP visat att förlust av Y-kromosomen i blodet hos män kan fungera som indikator på genetisk instabilitet, vilket i sin tur kan påverka uppkomsten cancer i andra delar av kroppen. Studien har publicerats i tidskriften Nature.
-
Analys med helgenomssekvensering ger större exakthet
2019-11-20
En ny studie från IGP visar att helgenomssekvensering bidrar till att öka exaktheten i genetiska studier, vilket i sin tur kan ge bättre förståelse för hur biomarkörer kan användas för att upptäcka sjukdomar. Resultaten är publicerade i den vetenskapliga tidskriften Scientific Reports.
-
Mekanism för hur nya blodkärl bildas upptäckt
2019-09-23
I en ny studie i tidskriften EMBO Reports visar forskare från IGP för första gången på en mekanism för hur nya blodkärl bildas och att den är avgörande för överlevanden av embryon och organfunktion. Resultaten skulle kunna utvecklas för att kontrollera nybildningen av blodkärl vid olika sjukdomar.
-
Kvinnors bukfetma starkare kopplad till diabetes och hjärt-kärlsjukdom
2019-09-10
En stor studie från IGP, med över 325 000 deltagare, visar att bukfetma är en stor bidragande orsak till diabetes och hjärt-kärlsjukdom. Studien visar också att bukfetma är en större riskfaktor för kvinnor än för män. Forskarna undersökte även hur vår genetik påverkar inlagringen av fett i buken och presenterar en ny, enklare metod för att mäta bukfetma.
-
Tre nya delar inom databasen The Human Protein Atlas
2019-09-09
I dagarna har HPA-projektet släppt en ny version av The Human Protein Atlas. Den innebär den största uppdateringen hittills, med de helt nya delarna Blood Atlas och Brain Atlas samt en Metabolic Atlas som tagits fram i samarbete med Chalmers.
-
Nytt WHO-reagens för autoantikroppar positivt för SLE-patienter
2019-09-06
I en ny studie, som publiceras i tidskriften Annals of the Rheumatic Diseases, presenteras ett WHO-referensreagens som tagits fram av ett internationellt team av forskare och kliniska laboratorier. Detta reagens kommer att underlätta justering av autoantikroppsanalyser vid SLE och därmed också diagnos och behandling av SLE-patienter.
-
Ny metod gör det lättare att identifiera rätt biomarkör
2019-08-28
Det finns ett ökande behov av biomarkörer för tidig diagnostik av sjukdomar och uppföljning av behandling. Så kallade exosomer är lovande för detta ändamål men det kan vara svårt att se vilka exosomer som kommer från vilka vävnader. I en ny studie presenterar forskare vid IGP och avknoppningsföretaget Vesicode AB en teknik för att effektivt identifiera ytproteiner på enskilda exosomer.
-
Nyupptäckta signalsamband kan bli viktiga för att behandla hjärntumörer
2019-08-21
Varje år får drygt 1 300 personer i Sverige diagnosen hjärntumör. Nu har ett internationellt samarbete bestående av forskare vid universitet i Wales, USA och Uppsala upptäckt målmolekyler som kan leda till nya behandlingsmetoder mot hjärntumörer. Resultaten presenteras idag i en artikel i tidskriften Cancer Discovery.
-
Många olika gener påverkar risken att utveckla astma, hösnuva och eksem
2019-08-19
I en ny studie från IGP har forskare funnit totalt 141 regioner (gener) i vår arvsmassa som förklarar en stor del av den genetiska risken bakom astma, hösnuva och eksem. Så många som 41 av de identifierade generna har inte tidigare kopplats till en ökad risk för dessa sjukdomar. Resultaten är publicerade i den vetenskapliga tidskriften Human Molecular Genetics.
-
Nytt test förbättrar diagnostiken av äggstockscancer
2019-07-01
Majoriteten av de kvinnor som opereras på misstanke om äggstockscancer visar sig vara helt friska eller ha godartade äggstocksförändringar. Nu har Ulf Gyllenstens forskargrupp tillsammans med kollegor vid Uppsala universitet och Sahlgrenska Akademin vid Göteborgs universitet utvecklat en ny metod där man med ett blodprov kan diagnosticera cancern utan att behöva operera för säkerhets skull. Den här upptäckten kan leda till färre onödiga och riskfyllda operationer.
-
Blockering av cellernas proteinfabriker kan minska spridning av cancermetastaser
2019-06-05
Nästan nittio procent av alla dödsfall i cancer beror på att tumören har spridit sig. En studie från IGP visar att en process som gör att cellerna kan sprida sig underlättas av nybildning av ribosomer, de komponenter i cellen där proteiner produceras. Resultaten öppnar för ett nytt sätt att behandla avancerad cancer. Studien publiceras i tidskriften Nature Communications.
-
Generna påverkar var fettet lagras på kroppen
2019-06-05
En studie från IGP har visat att huruvida du lagrar ditt fett runt midjan eller på låren påverkas av genetiska faktorer. Denna effekt är också mycket mer tydlig hos kvinnor jämfört med män. I studien, som publiceras i Nature Communications, tittade forskarna på fördelningen av fett hos nästan 360 000 frivilliga deltagare.
-
Kromosomanalys kan bedöma sjukdomsförlopp vid kronisk lymfatisk leukemi
2019-06-05
Utvärdering av kromosomförändringar kan användas för att ge prognos och förutse behandlingssvar vid cancerformen kronisk lymfatisk leukemi. Det visar IGP-forskaren Panagiotis Baliakas tillsammans med en internationell forskargrupp i en nyligen publicerad artikel i den ansedda tidskriften Blood.