Uppsala Genome Center

Provinlämning under påskveckan

Prover tas emot som vanligt under v.15, med undantag för prover till Sangersekvensering. Sista inlämning för dessa är måndag kl. 16:00. Sekvenseringsresultat kommer skickas ut under skärtorsdagen.

Uppsala Genome Center är del av genomikplattformen vid Science for Life Laboratory i Uppsala  och är även en del av NGI-Sweden, National Genomics Infrastructure.

Telefonnummer för provleverans:

IonTorrent: 070 - 425 02 69

PacBio: 070 - 425 02 85

Sanger Service: 070 - 425 05 98

Vår leveransadress:

Paket:

Uppsala Genome Center, IGP, UU

Husargatan 3

Ref. box 815

752 37 Uppsala

NOTE: opening hours for BMC package delivery is 8:00 to 16:30.

Brev:

Uppsala Genome Center

IGP, UU

Box 815

752 37 Uppsala

----------------------------------------

Från och med 1:a Februari 2013 alla nya projekt (inklusive prisförvrågningar) behandlas via NGI-Sweden gemensama web-portalen: https://ngisweden.scilifelab.se/.


Uppsala Genome Center erbjuder följande service:

  • Next Generation Sequencing med Ion Torrent PGM™, Ion Proton System and Pacific Biosciences RSII
  • Service med Sanger sekvensering
  • Verifiering av humana cellinjer med avseende på STR profil
  • Genotypning med STR-markörer
  • Separation av kundpreparerade prov med kapillärelektrofores med AB3730XL DNA Analyzer
  • Genexpressionsstudier på ABI7900HT med TaqMan®Gene Expression Assays 

Vi har mer än tio års erfarenhet av arbete med Sanger sekvensering och genotypning med STR markörer och har sedan 2008 erfarenhet av ”Next generation sequencing” med ABI SOLiD och Ion Torrent PGM™ System. UGC var en av första labratorier i Europa att få Ion Proton system; vi även använder oss av Pacific Biosciences RSII. Preparationen av fragment bibliotek automatiserades under 2011 och därmed ökade vår kapacitet från 20 till 100 bibliotek per vecka.


Instrumentering:

  • 2 Pacific Biosciences RSII systems
  • 2 Ion Torrent PGM™ 
  • 6 Ion Proton systems
  • 6 Ion OneTouch™ systems
  • 2 Ion Chef systems
  • 2 Covaris S2 systems
  • 1 Agilent 2100 Bioanalyzer
  • 1 Advanced Analytical Fragment Analyzer™
  • 1 Agilent Bravo pipetteringsrobot
  • 1 Hamilton STARlet pipetteringsrobot
  • 1 EpMotion 5070 för pipettering av reagenser
  • 2 ABI3730XL DNA Analyzer för kapillär elektrofores
  • 1 ABI7900HT Fast Real Time PCR System for qPCR, TaqMan® “Gene Expression Assays eller TaqMan® baserad SNP-typing


Vårt mål är att hitta individuella lösningar för våra kunders behov och vara kostnadseffektiva, flexibla och snabba i den service och tjänster vi erbjuder.

För projektdiskussioner och dyl välkommen att kontakta:

laboratoriechef Inger Jonasson (Inger.jonasson [at] igp.uu.se) - Sangersekvensering och genotypning;

projektsamordnare Olga Vinnere Pettersson (Olga.Pettersson [at] igp.uu.se) - Next Generation Sequencing och genomik.
 

Image: Ignas Bunikis

Design: Olga Vinnere Pettersson

(The original design of the DNA-spiral - Gwen Fischer)